Le site
propose un très grand nombre de protéines avec leur séquence et les coordonnées de tous leurs atomes.
Le site propose un très grand nombre de protéines avec leur séquence et les coordonnées de tous leurs atomes.
La page indiquée en lien est un formulaire permettant de rechercher une molécule.
Le plus simple est de taper son nom en anglais dans Compound Information et de cliquer sur search.
Choisissez ensuite la molécule dans la liste des résultats et cliquez sur le lien EXPLORE pour obtenir des renseignements complémentaires. Pour télécharger cette molécule cliquez sur Download / Display File et choisissez le format voulu.
On peut avoir directement le format pdb mais le fichier est beaucoup plus gros qu'un format compressé zip par exemple.
Afin que le navigateur n'ouvre pas le fichier, cliquez avec le bouton droit de la souris sur le lien du format choisi et sélectionnez la commande adéquate (Enregistrer la cible sous... dans Internet Explorer par exemple).
Attention : le fichier au format compressé zip ne comporte pas d'extension, il faut modifier son nom dans l'explorateur de Windows et ajouter l'extension .zip afin que la décompression puisse se faire grâce à Winzip par exemple.
La décompression donne un fichier dont l'extension est .ent qui sera directement interprété par RASMOL.
En revanche, si l'on veut intégrer cette séquence dans ANAGENE, il faudra quelques manipulations complémentaires.
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