Les séquences moléculaires ont été regroupées dans le fichier globines.pir à télécharger par un clic droit. Si après téléchargement le fichier a une double extension .edi.txt enlever le .txt dans l'explorateur de Windows.

Un fichier .pir est au format texte, sa structure est donc visible dans un éditeur de texte, il contient les noms des molécules (après le signe >) et la séquence à la ligne au format une lettre.

Ce fichier s'ouvre dans Phylogène comme un tableau de molécules en prenant soin de choisir la catégorie de molécules non alignées.
Il suffit alors de faire aligner les molécules par le logiciel, on peut alors obtenir la matrice de distance et faire tracer l'arbre.

La matrice est un peu différente de celle obtenue "à la main" dans Anagène mais l'arbre n'est pas différent si l'on a choisi dans les options la méthode NJ (Neighbor Joining).