Dans Evolmol, choisir Calcul d'un arbre puis Choix d'un fichier contenant une matrice. Sélectionner le fichier concerné et valider ce choix. Opter pour Calcul de l'arbre et écriture dans un fichier et valider. Evolmol a alors écrit un fichier portant le même nom que la matrice et portant l'extension .arb.

Revenir au menu précédent par la touche Echap et choisir Visualisation de l'arbre puis Choix d'un fichier contenant un arbre, choisir le fichier .arb concerné, valider deux fois puis sélectionner visualisation de l'arbre, valider.

Une fois l'arbre obtenu, il faudra le "raciner" sur l'espèce la plus ancienne et éventuellement faire quelques "pivots" pour la présentation.

Dans l'exemple choisi, l'arbre obtenu en mettant bout à bout les deux chaînes de la FSH est le suivant :